Pada malam yang gelap, polisi Jepang digerebek oleh seorang mata-mata. Badan intelijen berbagai negara – seperti MI6 Inggris, BDN Jerman, dan CIA Amerika – serta file rahasia FBI akan diambil, namun petugas keamanan publik yang dipimpin oleh Tooru Amuro tiba tepat pada waktunya. Mata-mata itu mencuri mobil dan melarikan diri. Mata-mata dan Amuro kemudian terjebak dalam situasi yang sangat panas di jalan raya, dan saat hal itu akan menyebabkan kecelakaan dengan banyak mobil, mobil mata-mata itu terkena peluru senapan agen FBI Shuichi Akai dan jatuh di jalan raya. Keesokan harinya, Conan dan teman-temannya pergi ke akuarium yang baru direnovasi di Tokyo. Di bawah atraksi utama, sebuah bianglala, Conan menemukan seorang wanita menarik sendirian dan terluka. Mata kiri dan kanannya berbeda warna.
